Sa dernière visite au Rwanda remonte à 2010, après laquelle il a été révélé qu'il s'était enfui en Afrique du Sud, un pays où il menait diverses affaires.

Son départ a été motivé par des révélations le liant à des affaires d'évasion fiscale et à des relations avec des groupes subversifs cherchant à déstabiliser la sécurité du Rwanda, qu'il soutenait également financièrement.

Né vers 1941 au Rwanda, Rujugiro a passé une grande partie de sa vie en tant que réfugié au Burundi, où il a initié son entreprise de tabac.